Escalafy contempla un solo costo por producto, no dos lotes con costos distintos conviviendo. Hay dos formas de resolverlo, y las dos son válidas.
Opción 1: mantener el costo viejo
Dejas el costo anterior hasta agotar aproximadamente ese stock, y recién ahí lo cambias al nuevo.
Opción 2: cargar un promedio
Desde el momento de la compra cargas el promedio de ambos. Por ejemplo, si tienes 20 unidades a $7 y compras 20 a $5, cargas $6.
Si quieres ser más preciso con el histórico, puedes reprocesar 45 días con el costo viejo y después reprocesar solo los días posteriores al cambio con el costo nuevo.