El inventario es por organización: cada marca tiene su propio inventario y el stock no se comparte entre organizaciones.
Lo que sí puedes hacer
Dentro de una misma organización, puedes vincular productos de distintos canales —por ejemplo una publicación de Mercado Libre y un producto de Shopify— a un mismo ítem de inventario, para que ambos descuenten del mismo stock.
Eso es justamente el propósito del módulo: unificar el stock real detrás de publicaciones que viven en plataformas distintas.